종자기사 유전자원 및 품종의 분류 — 분자표지의 강점과 한계

분자표지는 제한효소로 DNA를 자르는 RFLP처럼 유전체 DNA의 다형성을 이용한 마커다. 개체의 유전적 특성을 가장 근본적으로 반영하므로 환경의 영향을 받지 않고 정확한 선발이 가능하다. 대표적인 예로 RFLP, RAPD, SSR 등이 있다.

분자표지의 가장 큰 장점은 생육 초기 단계에서 유전형질을 판단할 수 있다는 점이다. 꽃이나 열매가 맺히기를 기다리지 않고 씨앗이나 모종 단계에서 유전자를 확인하므로 육종 기간을 크게 단축한다. 열성 형질이라도 유전자 존재 여부를 직접 확인할 수 있어 후대검정이 필수는 아니다.

그러나 분자표지가 만능은 아니다. 수량이나 생산성처럼 다수의 유전자가 복합적으로 작용하고 환경의 영향도 큰 형질은 단일 유전자 마커로 예측하기 어렵다. 생산성 검정은 현장에서 실제 수확량을 측정하는 전통적인 방법에 주로 의존한다.

유전 정보 분석 도구라는 성격도 분명히 해 둔다. 품종감별, 간접선발, 유전자지도 작성은 유전 정보를 읽는 일이라 적합하다. 그러나 인공종자 제작은 종자를 인위적으로 만들어내는 물리적·생리적 공정이므로 분석 정보와는 직접 관련이 없다.

마커마다 특성도 다르다. RAPD는 짧은 임의 프라이머를 사용해 빠르지만 실험 조건에 민감하여 재현성이 가장 낮다. RFLP, AFLP, isozyme은 표준화된 조건에서 재현성이 높다. 유전적 거리가 먼 개체일수록 다형성이 높아 구별에 유리하고, 근연일수록 구별이 어렵다.