호수와 저수지의 영양상태는 영양염류의 풍부함에 따라 빈영양, 중영양, 부영양의 세 단계로 구분된다. 빈영양은 영양염류가 적어 물이 맑고 생산력이 낮으며 수심이 깊은 경향이 있고, 부영양은 영양염류가 풍부해 조류가 많이 번식하고 물이 탁하며 수심이 얕은 경향이 있다. 이 세 단계는 환경과학에서 호수의 노화 과정 설명을 위한 표준 분류이다.
부영양화는 식물플랑크톤의 과도한 증식을 유발하는 현상으로, 주된 원인은 질소와 인의 과잉 유입이다. 생활하수나 농업 배출수 등에 포함된 질소와 인이 수계로 유입되면 식물플랑크톤의 먹이가 되어 녹조 현상이나 용존산소 고갈을 초래할 수 있다. 이로 인해 다른 수생생물에 피해가 발생할 수 있음을 기억한다.
칼슨의 영양상태지표(TSI)는 호수의 부영양화 정도를 평가하기 위해 클로로필-a, 투명도, 총인 세 가지 변수를 사용하여 0~100 범위로 나타낸다. 이 지표는 인과 조류 및 투명도의 관계를 중심으로 개발되었으므로 질소는 칼슨 TSI의 구성 변수에 포함되지 않는다. TSI의 세 변수는 부영양화 평가 시 핵심적으로 연계하여 기억해야 한다.
수층의 수직적 구분은 빛의 투과와 생물 분포에 따라 연안대, 준조광대, 심연대로 나뉜다. 연안대는 바닥까지 빛이 닿아 수생식물이 자라는 구역이고, 준조광대는 표층 수역으로 광합성이 활발한 영역이며, 심연대는 빛이 거의 닿지 않아 광합성이 일어나지 않는 깊은 수역이다. 심연대에서는 광합성보다 호흡이 우세한 환경이므로 광합성 관련 설명이 심연대에 적용되면 주의해야 한다.
내부파는 밀도가 다른 수층 경계에서 발생하는 파동으로 수직 혼합을 촉진하고 저층의 영양염을 표층으로 공급하여 식물플랑크톤 생산을 높일 수 있다. 그러나 내부파와는 별개로 바람이나 해류, 지형에 의해 발생하는 용승류는 대규모 상승 현상으로 내부파의 직접적인 영향으로 보기 어렵다.
하천 및 하구 생태계 특성에서는 여울과 소와 같은 자연적 지형 요소가 다양한 서식처를 제공하여 생물다양성을 높인다는 점을 기억한다. 하천 복원은 자연적인 곡선과 여울·소를 회복하는 방향이어야 하며, 하천을 직선화하는 직강화는 오히려 생태계 단절을 초래하는 파괴적 공법이다.